Grand Theft Auto 3D är en mod för GTA III som syftar till att återskapa hur spelet såg ut innan det släpptes. Med hjälp av tidiga skärmdumpar, Alpha Mines och pre-release gameplay tillbringade teamet eller moddarna över fyra år på att skapa denna tidiga version av GTA III. Efter denna långa utvecklingscykel släpptes modden äntligen i början av januari. Moden fungerar med PC-versionen av GTA III. Denna version av GTA III var ursprungligen planerad att släppas på PS2 och Dreamcast. Moddingteamet ville inkludera så många av de tidiga utvecklingstillgångarna som möjligt, till och med lägga till den ursprungliga HUD. Liberty Citys layout är också väldigt annorlunda. Många byggnader saknas, ersatta av smalare strukturer eller gräs. Den övergripande konststilen är mer färgstark och liknar äldre GTA-titlar.
Fans kan också lägga märke till att polisbilar och andra utryckningsfordon ser mycket mer ut som sina verkliga motsvarigheter i New York. GTA III fick några visuella förändringar efter de tragiska händelserna eller 9/11. En sådan förändring var att polisbilarna blev svartvita istället för de blåvita patrullbilarna som hittades i New York och sågs i tidiga skärmdumpar eller GTA III. Claude, den tysta huvudpersonen eller GTA III, ser väldigt annorlunda ut. Som GTA-forumanvändaren 3li0507 påpekade, gick Rockstar igenom många olika utseenden för Claude, som vid ett tillfälle fick honom att se riktigt blek ut. Teamet eller moddarna ändrar inte bara visuellt GTA III för den här rullen, utan redigerar hur bilar hanteras, ändrar hur spelet känns och rör sig med andra bitar eller GTA III. Slutresultatet är ett spel som känns som att det har tappats från ett alternativt universum.